投稿后系统会对稿件进行查重，编辑会对重复率小于20%且重点内容无重复的稿件进行初审，通过初审的稿件由编辑送给1—2位审稿人评审（本刊采用双盲同行评议模式），之后编辑和主编结合外审专家意见决定稿件修改、录用或退稿。稿件评审时间一般为14—21天。经审理拟刊用的稿件，编辑将同行评审结果和格式方面的修改建议一起返给作者。

按审稿意见修改达到本刊要求被录用的稿件经进一步审核和加工后，文稿将进入组版状态。同一时间，编辑部会将组版状态的稿件上传到知网首发。编辑部会对组版的稿件进行排版，编辑和主编对排版后的稿件校对三次以上，其间作者核对校样，之后送专家进行印前审读，最后责任编辑通读小样，稿件进入印刷状态。作者稿件发表后将获赠当期《内蒙古农业大学学报（自然科学版）》两册。